De Heineken-topman kreeg in 2012 een salaris van één miljoen euro, blijkt uit het jaarverslag. Daarnaast ontving Van Boxmeer drie bonussen: een bonus van 2,5 miljoen voor de overname van Asia Pacific Breweries, een retentiebonus omdat hij bij Heineken blijft en een kortetermijnbonus van 1,4 miljoen. Bovendien kreeg Van Boxmeer een toezegging voor aandelen en opties ter waarde van ruim twee miljoen.